Spiec-Easi sur R (DUBii)

Bonjour à tous,

Je souhaiterai installer le package SpiecEasi pour R mais avant il faut installer "devtools" et j'ai l'impression que je n'ai pas les droits qui permettent ça...
Voici le GitHub : GitHub - zdk123/SpiecEasi: Sparse InversE Covariance estimation for Ecological Association and Statistical Inference
Je sais que vous n'êtes pas censé faire de l'aide pour R mais avez vous une idée de ce qui ne va pas pou l'installation de "devtools" !
Voici le message d'erreur que j'obtiens à la fin :

Warning in dir.create(destdir <- file.path(instdir, "help", "figures")) :
cannot create dir '/shared/mfs/data/home/mlavierichard/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/usethis/help/figures', reason 'Device or resource busy'
** building package indices
** testing if installed package can be loaded

  • DONE (usethis)
  • installing source package ‘devtools’ ...
    ** package ‘devtools’ successfully unpacked and MD5 sums checked
    Warning in dir.create(outMetaDir) :
    cannot create dir '/shared/mfs/data/home/mlavierichard/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/devtools/Meta', reason 'Device or resource busy'
    Error in .install_package_description(".", instdir, built_stamp) :
    cannot open directory '/shared/mfs/data/home/mlavierichard/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/devtools/Meta'
    ERROR: installing package DESCRIPTION failed for package ‘devtools’
  • removing ‘/shared/mfs/data/home/mlavierichard/R/x86_64-redhat-linux-gnu-library/3.5/devtools’
    Warning in install.packages :
    installation of package ‘devtools’ had non-zero exit status

The downloaded source packages are in
‘/tmp/Rtmpbb04RP/downloaded_packages’

Et effectivement devtools n'est pas installé... :

library(devtools)
Error in library(devtools) : there is no package called ‘devtools’

Merci beaucoup,

Mathias

Bonjour @MathiasLR,

Vous utilisez via RStudio ?
Je peux [tenter d'] y installer la library SpiecEasi pour qu'elle soit disponible du plus grand nombre ?

Bonjour @MathiasLR ,

Je pense que le paquet ne s'installe pas dans votre home à cause de l''erreur :

Cette erreur est malheureusement connu (cf sujet: Device or resource busy: '/shared/home/ - Support IFB Core Cluster - IFB Community Support)

Nous travaillons dessus mais n'avons pas encore de solution. Désolé du désagrément.
Pouvez-vous quand même réessayer (l'erreur se produisant "aléatoirement") ?

Salutations.

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Bonsoir !

Exactement c'est aléatoire !!
Après plusieurs essais voilà que c'est passé.... C'est à savoir :wink: !

Merci et bon week-end,

Mathias